知网查重文件过小的主要原因包括：1.文件内容不完整，导致查重范围过小；2.格式不规范，影响查重结果准确性；3.文本密度过低，难以有效对比；4.文本重复率较低，难以检测到抄袭。针对这些原因，建议扩大文件内容、规范格式、增加文本密度、提高重复率，以提高查重效果。

当知网查重文件过小时，可能会导致查重结果不准确，甚至错失重要的抄袭发现。因此，务必注意论文查重文件的大小，保证包含完整内容。合理设置查重文件大小，可以有效提高查重的准确性，确保学术诚信。同时，建议定期更新查重文件，及时发现和解决可能存在的问题。